Program Studi Magister Biologi memiliki dua jalur peminatan, yaitu:
- Biologi Molekuler, Sel, dan Organisme
Biologi Molekuler, Sel, dan Organisme merupakan integrasi dari keilmuan multidisiplin yang mencakup bidang molekuler, sel, dan semua kelompok organisme. - Biologi Lingkungan
Biologi Lingkungan menekankan pendekatan yang berbasis pada konsep-konsep biologi lingkungan/ekologi untuk memahami kompleksitas interaksi di alam dan merespons permasalahan lingkungan.
| SEMESTER I | Kuliah Wajib Bersama | SKS | TOTAL 9 SKS | ||
| Biologi Sistem | 3 | ||||
| Perancangan Penelitian | 2 | ||||
| MK Pilihan | 4 | ||||
| SEMESTER II | Molecular, Cell, and Organismal Biology | SKS | Environmental Biology | SKS | TOTAL 12 SKS |
| Penelitian Magister I | 4 | Penelitian Magister I | 4 | ||
| Biologi Sel Lanjut | 2 | Biodiversitas Tropika | 2 | ||
| Genetika Molekular Lanjut | 4(1) | Metode Ekologi | 4(1) | ||
| MK pilihan | 2 | MK pilihan | 2 | ||
| SEMESTER III | Molecular, Cell, and Organismal Biology | SKS | Environmental Biology | SKS | TOTAL 10 SKS |
| Penelitian Magister II dan Seminar | 4 | Penelitian Magister II dan Seminar | 4 | ||
| Fisiologi Lanjut | 3 | Ekologi Populasi | 3 | ||
| Bioinformatika | 3(1) | Analisis Ekosistem | 3(1) | ||
| SEMESTER IV | Molecular, Cell, and Organismal Biology | SKS | Environmental Biology | SKS | TOTAL 5 SKS |
| Tesis dan Sidang Akhir | 2 | Tesis dan Sidang Akhir | 2 | ||
| MK pilihan | 3 | MK pilihan | 3 | ||
| No. | Mata Kuliah Pilihan | SKS |
| 1 | Ekologi Akuatik | 2 |
| 2 | Biologi Kanker | 2 |
| 3 | Pensinyalan pada Tumbuhan | 2 |
| 4 | Ekologi Terestrial | 2 |
| 5 | Ekofisiologi Tumbuhan | 2 |
| 6 | Mekanisme Perkembangan Tumbuhan | 2 |
| 7 | Ekologi Mikroba Lanjut | 2 |
| 8 | Biologi Sel dan Molekuler Tumbuhan | 2 |
| 9 | Ekologi Serangga | 2 |
| 10 | Ekologi Molekuler | 2 |
| 11 | Neurosains Lanjut | 2 |
| 12 | Entomologi Medis dan Forensik | 2 |
| 13 | Epidemiologi Molekuler | 2 |
| 14 | Toksikologi Reproduksi dan Perkembangan | 2 |